共聚焦顯微鏡的共聚焦成像能有效抑制焦平面外的雜散光和非測(cè)量光進(jìn)入探測(cè)器，實(shí)現(xiàn)單一焦層面成像，使分辨率大為提高。載物臺(tái)沿橫向均勻移動(dòng)時(shí)，可形成清晰的單層圖像，沿縱向移動(dòng)，可實(shí)現(xiàn)樣品不同深度的逐層掃描，經(jīng)過(guò)三維重建得到樣品的三維立體結(jié)構(gòu)，即所謂的“光學(xué)CT”。使用熒光探針對(duì)樣品進(jìn)行標(biāo)記后再運(yùn)用共聚焦顯微鏡觀測(cè)，不僅可觀察固定的各種細(xì)胞和組織結(jié)構(gòu)，還可對(duì)活細(xì)胞的形態(tài)、結(jié)構(gòu)、離子等進(jìn)行定性定量定時(shí)觀察及測(cè)定。

　　傳統(tǒng)的光學(xué)顯微鏡使用的是場(chǎng)光源，標(biāo)本上每一點(diǎn)的圖像都會(huì)受到鄰近點(diǎn)的衍射或散射光的干擾。而共聚焦顯微鏡則在熒光顯微鏡成像基礎(chǔ)上利用激光作為光源，采用共軛聚焦裝置，并利用計(jì)算機(jī)對(duì)所觀察分析對(duì)象進(jìn)行數(shù)字圖像處理的一套觀察和分析系統(tǒng)。

　　共聚焦顯微鏡與傳統(tǒng)顯微鏡相比，具有高分辨率、高靈敏度、高放大率等特點(diǎn)。隨著軟件開(kāi)發(fā)和應(yīng)用技術(shù)的完善，共聚焦顯微鏡已成為形態(tài)學(xué)、分子細(xì)胞生物學(xué)、神經(jīng)科學(xué)、藥理學(xué)、遺傳學(xué)等領(lǐng)域中新一代強(qiáng)有力的研究工具。